Ο Σέρχιο Εζεκιέλ Αραούχο γεννήθηκε στις 28 Ιανουαρίου του 1992 στην πόλη Νεουκέν της Αργεντινής. Εντάχθηκε από πολύ μικρή ηλικία στα τμήματα υποδομής της Μπόκα Τζούνιορς και έκανε το ντεμπούτο του στην πρώτη ομάδα τη σεζόν 2009-10, στα 18 του χρόνια. Αγωνίστηκε συνολικά σε 22 αγώνες (1 γκολ) και πανηγύρισε το πρωτάθλημα Απερτούρα 2011.

Το 2012 δόθηκε δανεικός στην Μπαρτσελόνα Β, με την οποία αγωνίστηκε σε 34 αγώνες και πέτυχε 7 γκολ τη σεζόν 2012-13. Ακολούθησαν οι δανεισμοί του στην Τίγκρε της Αργεντινής τη σεζόν 2013-14 (12 αγώνες – 2 γκολ) και στην Λας Πάλμας τη σεζόν 2014-15, με την οποία σκόραρε 25 φορές σε 43 αγώνες της Σεγούντα Ντιβισιόν!

Η ισπανική ομάδα επέστρεψε το 2015 στην Πριμέρα Ντιβισιόν με τη βοήθεια του «Ελ Τσίνο», ο οποίος αγωνίστηκε σε 43 αγώνες και πέτυχε 7 γκολ με τον σύλλογο των Καναρίων Νησιών στη μεγάλη κατηγορία του ισπανικού ποδοσφαίρου σε μιάμιση σεζόν (Αύγουστος 2015-Δεκέμβριος 2016).

Την περίοδο 2016-17, στο διάστημα που αγωνίστηκε με την ΑΕΚ ως δανεικός, ο Αραούχο πήρε μέρος σε 21 αγώνες σε Πρωτάθλημα και Κύπελλο, πετυχαίνοντας 9 γκολ και μοιράζοντας 6 ασίστ. Με το δικό του νικητήριο γκολ στον αγώνα με τον Πανιώνιο στη Νέα Σμύρνη, έφερε την ΑΕΚ στην πρώτη θέση των playoffs, κάνοντας το πρώτο καθοριστικό βήμα για την επιστροφή της ομάδας μας στις Ευρωπαϊκές διοργανώσεις.

Ακολούθησε η ανανέωση του δανεισμού του στην ΑΕΚ την τελευταία μέρα του Αυγούστου του 2017 και ο Αργεντινός σκόραρε 11 φορές σε 23 ματς, βάζοντας έντονα και τη δική του σφραγίδα στην κατάκτηση του τίτλου από την ΑΕΚ. Στο Κύπελλο είχε 2 γκολ σε 8 αγώνες και στο Europa League ένα τέρμα σε 8 ματς. Στις 31 Ιανουαρίου 2020, πάλι τελευταία ημέρα των μεταγραφών, επέστρεψε στην ΑΕΚ για την τρίτη του θητεία με την κιτρινόμαυρη φανέλα και σε 15 αγώνες πρωταθλήματος σκόραρε τρεις φορές.

Στις 16 Ιουλίου 2021 ο Αραούχο επέστρεψε και πάλι στην ΑΕΚ, αυτή τη φορά με μεταγραφή, υπογράφοντας συμβόλαιο για 3+1 χρόνια.